Giải mã trình tự bộ gen “Locusta migratoria” (châu chấu)

Ngày cập nhật 13 Tháng Hai 2014

Các nhà khoa học thuộc BGI (Beijing Genome Institute), Viện Hàn lâm Khoa học Trung Quốc, Viện Động vật học và các Viện khác đã thực hiện thành công việc giải mã toàn bộ trình tự genome của Locusta migratoria, một trong những loài châu chấu có phổ lan rộng mạnh mẽ nhất.Đăng ngày 13-02-2014 trong chuyên mục Tin thế giới

Toàn bộ genome có kích thước 6.5 gigabytes, là bộ genome lớn nhất của côn trùng được giải trình tự cho đến nay. Kết quả mới nhất được công bố trên tạp chí Nature Communications.

Họ tiến hành giải trình tự bộ gen theo phương pháp “next-generation sequencing technology”, với cơ sở dữ liệu khổng lồ 721Gb, bao phủ gấp 114 lần của kích thước genome châu chấu 6.3Gb. Họ đã tiến hành chú thích trên bộ gen (annotation) và dự báo có 17.307 kiểu gen (gene models), phân lập trên 2.639 các họ gen có tính chất lập lại. Họ còn khám phá rằng có mười họ gen đứng đầu (top ten repeat families) chỉ đại diện cho 10% toàn bộ trình tự genome cho thấy không có những họ gen biểu hiện tính chất “dominant” trong genome con châu chấu (L. migratoria).

Xem BGI’s news:

http://www.genomics.cn/en/news/show_news?nid=99886.

Hoặc http://www.nature.com/ncomms/2014/140114/ncomms3957/full/ncomms3957.html.